液压升降设备系统中手动泵的应用优势主要体现在以下几个方面：

1. 高效性：液压手动泵具有高效稳定的性能，其输出能力大，可以控制运动速度，避免冲击和震动，其输出压力和流量可以根据需要进行调整，从而提高了工作效率和设备的工作效益。
2. 安全性：液压手动泵具有高度自动化的特性，其工作过程中能够进行自动控制，降低了人为操作的风险。此外，手动泵还可以设置压力开关和过流阀等安全保护装置，保障设备和操作者的安全。
3. 灵活性：液压手动泵适应性强，可以根据不同的工作环境和需求进行调整，广泛应用于各种机械设备中。其结构简单、安装方便，工作稳定，可靠性高，使得设备操作更加方便、灵活。
4. 符合人体工学设计：液压手动泵的设计符合人体力学，使得操作更加简单且舒适。手柄的操作力较小，可以降低打压的次数，对工作效率有很大的提升。
5. 独立性：液压手动泵不受电力或气源的限制，尤其在偏远地区或野外作业时，其可靠性更加显著。这使得它在一些特殊环境或紧急情况下能够正常工作。
6. 简单维护：液压手动泵的结构相对简单，维护成本较低，部件可替换性强。这使得在设备维护方面更加便捷和经济。
7. 适应性强：无论是传输腐蚀性液体还是高粘稠液体，液压手动泵都能应对自如。这种广泛的适应性使得它在各种工业应用中都能找到合适的应用场景。

总之，液压升降设备系统中手动泵的应用优势在于其高效性、安全性、灵活性、符合人体工学设计、独立性、简单维护和广泛的适应性。这些优势使得液压手动泵在各类机械设备中得到广泛应用。